С открытием нового корпуса онкологического диспансера в феврале 2009 года в диспансере был открыт лекарственный отдел (аптека), площадью  150 м². В подразделении аптеки имеются помещения для хранения химиопрепаратов, наркотических лекарственных средств и прекурсоров. Склад для хранения изделий медицинского назначения,

дезинфицирующих средств и лекарственных препаратов. С 2012 года в аптеке производится отпуск по рецепту химио-таргентных препаратов  онкологическим больным с соблюдением отчетно-учетной документации.

Заведует аптекой Ереп Валентина Васильевна.

Каримбаева Еркеш Мухтаровна – провизор, отвечающая за прием и хранение химиопрепаратов;

Нугуманова Гульмира Опабековна – фармацевт, отвечающая за хранение и прием лекарственных препаратов общего назначения;

Фармацевт: Смирнова Ольга Александровна.

Сотрудники отдела прошли специализацию и повышение квалификации в медицинских институтах и университетах фармакологии Казахстана, Италии, России.